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人間たちはアルセウスから“命の宝玉”を借り受け、荒廃していたミチーナを緑豊かな土地に変えたが、命の宝玉を返す約束を破ってしまう。裏切られ、激しい怒りを抱えたまま長い眠りについたアルセウスは再び目覚め、サトシたち一行はアルセウスの怒りを鎮めるため古代のミチーナへ時空を超えた旅に出るが……。

世界的な人気を誇る“ピカチュウ・ザ・ムービー”の『劇場版ポケットモンスター ダイヤモンド＆パール』第3弾。これまで繰り広げられてきたディアルガ、パルキア、ギラティナの神々の戦いの謎が明らかになるほか、ポケモン映画史上初のタイムスリップ・アドベンチャーが展開。サトシとピカチュウが時空を超えた冒険の旅に出る。すべてを生み出したという“そうぞうポケモン”のアルセウスや、ギザみみピチューなど初登場のキャラクターにも注目。